Las jaulas de crianza son objeto de objeciones en muchos países, ya que se la culpa de contaminación, propagación e infección de enfermedades (de especies de piscifactoría a especies salvajes), escapes que amenazan a otros peces acuáticos y mariscos, etc.
En este marco, los RAS y las HFS se presentan como soluciones, o parte de la solución. Mientras que el RAS (Recycling Aquaculture System) utiliza un circuito cerrado de agua (tratada y limpiada de vez en cuando) el HFS (Hybrid Flow-through System) utiliza agua subterránea y fría para bombearla y mantener el flujo en los estanques y luego devolverla al océano. Ambos tienen buenos índices de conversión (1,1 aseguran) y menor mortalidad (que las jaulas de crianza tradicionales), pero necesitan grandes inversiones y trabajo de construcción.
Hoy las primeras ya están en producción, y al parecer podrían ser una alternativa para reducir las jaulas de crianza en determinadas zonas donde las autoridades imponen restricciones para el salmón, la trucha y otras especies.